深圳市萬科梅沙書院的辦學目標是培養具有中國精神的世界公民與領袖人才。為實現這一目標，萬科梅沙書院課程以國際文憑IB課程結構為框架，文理兼顧、選課尊重差異、融合知識傳授與能力培養;以扎實且具有民族文化的國家課程、博雅且個性化的美國高中課程為內容。學校將三種豐富而深厚的教育精髓創新地融合形成萬科梅沙獨特的國際化校本課程。促進學生的全面發展、個性發展和卓越發展。萬科梅沙書院以資優生教育、科學技術工程與數學(STEM)教育、藝術教育的三類課程作為核心競爭力課程。

　　學校通過先進的教育理念、校內校外豐富的教育資源來確保資優生的充分成長：1.學生通過考核，可允許免修某些課程;2.在班內外老師引導學生去研究更多更深更廣的問題;3.用高級別課程的學分沖抵低級別必修課學分;4.學生通過參加學校以外的在線課程學習換取學分;5.通過在國外中學與大學里學習的經歷換學分等機制，來實踐“學生按需選學，學校按需施教”的教育創新，確保學生能夠更有價值、更自由、更高效地學習。6.通過在全球范圍內的社會實踐平臺如全球事務聯盟來關注全球事務和力行，培養領導力。

　　學校建設科學技術工程與數學(STEM)課程來引領學生像科學家那樣的思考與探究，培養學生研究能力、批判性思維能力、創新能力和團隊合作能力。通過1.科學與數學建模課程、2.大學水平的科學項目如USAYPT、PIONEER RESEARCH、IGEM等的研究3.機器人、PHYSICS BOWL、哈麻數學比賽、普林斯頓數學競賽等比賽4. edx，coursera等大學STEM網絡課程、5. 創建空間概念的“技術中心”：充分利用當地的如萬科、騰訊、華為、華大基因、光啟研究院、比亞迪等優質企業資源，“創客”工作坊，為學生創建在“做”中“學”以及創新的平臺;6.與當地的職業高中、職業學院及國內外的大學進行緊密的科學工程項目的合作。

　　學校十分注重藝術教育，培養學生的想象力和創新能力：1.成立藝術生源基地。2.引進大學學分課程：與美國的藝術與設計學院合作，引進大學學分課程，讓學生有機會在高中階段就能在大學客座教授的指導下挑戰大學的藝術課程，有助于培養T字型的全面發展的創新人才。3. 為學生提供與世界一流專家，學者，藝術家等接觸與學習的機會。

　　研究性地教與學和跨學科地教與學是萬科梅沙書院的教育教學方式及特色。1.每一位學生從進入學校的第一天，就必須在老師的帶領下，探索自己的學術興趣、調研，在高一的學期末，確定自己學術論文的題目。在高二的學期末，完成一篇學術論文，老師對論文結構、調研、參考文獻及表述進行評價。2.在一年的AP課程中，老師創建跨學科研究項目，如都江堰水利工程，由科學老師與人文科學老師共同指導十周，讓學生從不同的學科角度來研究同一個問題，達到提升學生的批判性思維能力和學術能力。3.中英文寫作橫跨所有學科。